Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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