Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms