Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ap4s1Q9WVL1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms