Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slit3Q9WVB4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slit3Q9WVB4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms