Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms