Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cited4Q9WUL8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms