Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6cQ9WTM3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6cQ9WTM3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms