Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms