Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psma4Q9R1P0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms