Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Htra1Q9R118 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra1Q9R118 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms