Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrpxQ9R0M3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms