Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod3Q9R0E1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod3Q9R0E1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms