Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr54Q9R0D8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Wdr54Q9R0D8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms