Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh11Q9QYF1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh11Q9QYF1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh11Q9QYF1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh11Q9QYF1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh11Q9QYF1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh11Q9QYF1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh11Q9QYF1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Rdh11Q9QYF1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Rdh11Q9QYF1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh11Q9QYF1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh11Q9QYF1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Rdh11Q9QYF1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Rdh11Q9QYF1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh11Q9QYF1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh11Q9QYF1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh11Q9QYF1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Rdh11Q9QYF1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Rdh11Q9QYF1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh11Q9QYF1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh11Q9QYF1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh11Q9QYF1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh11Q9QYF1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Rdh11Q9QYF1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Rdh11Q9QYF1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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Rdh11Q9QYF1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Rdh11Q9QYF1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Rdh11Q9QYF1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Rdh11Q9QYF1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Rdh11Q9QYF1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh11Q9QYF1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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