Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr2e3Q9QXZ7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr2e3Q9QXZ7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms