Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcsk1nQ9QXV0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms