Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG9

Tinf2, TERF1-interacting nuclear factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tinf2Q9QXG9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tinf2Q9QXG9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tinf2Q9QXG9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms