Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChmQ9QXG2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChmQ9QXG2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms