Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim44Q9QXA7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim44Q9QXA7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms