Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkl2Q9QUK0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms