Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc2lQ9JME7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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