Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp1Q9JLK7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp1Q9JLK7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms