Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms