Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms