Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms