Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms