Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms