Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbr1Q9JIT0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms