Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgi1Q9JIA1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms