Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ropn1Q9ESG2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms