Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capn12Q9ER56 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms