Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Barx1Q9ER42 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms