Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr6Q9EQ16 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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