Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms