Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc38a3Q9DCP2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc38a3Q9DCP2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc38a3Q9DCP2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc38a3Q9DCP2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc38a3Q9DCP2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms