Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pop7Q9DCH2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pop7Q9DCH2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop7Q9DCH2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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