Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms