Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Med27Q9DB40 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Med27Q9DB40 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Med27Q9DB40 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Med27Q9DB40 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Med27Q9DB40 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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