Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD6

Pfn3, Profilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn3Q9DAD6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms