Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms