Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmbim4Q9DA39 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms