Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N5

Cib4, Calcium and integrin-binding family member 4, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib4Q9D9N5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
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Cib4Q9D9N5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Cib4Q9D9N5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Cib4Q9D9N5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cib4Q9D9N5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cib4Q9D9N5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cib4Q9D9N5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib4Q9D9N5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms