Protein–RNA interactions for Protein: Q9D979

Uncharacterized protein C17orf64 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D979 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D979 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D979 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D979 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D979 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D979 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D979 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D979 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D979 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D979 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D979 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D979 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D979 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D979 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D979 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D979 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D979 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D979 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D979 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D979 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D979 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D979 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D979 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D979 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D979 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D979 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D979 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D979 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D979 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D979 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D979 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D979 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D979 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9D979 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9D979 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9D979 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D979 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D979 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D979 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D979 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D979 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D979 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D979 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D979 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D979 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D979 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D979 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D979 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D979 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D979 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D979 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D979 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D979 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D979 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms