Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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