Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp4cQ9D7F7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms