Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf13Q9D777 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms