Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms