Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tubb4aQ9D6F9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms