Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms