Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Zcchc13Q9D548 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Zcchc13Q9D548 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Zcchc13Q9D548 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Zcchc13Q9D548 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Zcchc13Q9D548 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Zcchc13Q9D548 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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